大多数猪用B超机可分为主机和探头两部分。主机上包含成像屏幕、控制面板和计算机化硬件。探头装有晶体，是唯一接触动物的设备。



由于猪用B超机设备成本高昂，因此在不同养猪场使用一台机器的情况并不少见。因此，必须确保猪用B超机设备不会在养猪场之间携带致病微生物。为防止这种情况发生，设备应在每次使用后进行清洁和消毒。每次使用后清洁设备对于减少致病微生物的数量以及防止猪用B超机单元的橡胶部件在粪便中变质非常重要。每次使用猪用B超机装置时，都应使用软刷或毛巾对其进行清洁以去除粪便。在清洁过程中，探头和主机应远离流水，但可以使用湿的一次性毛巾将它们擦干净。

设备清洁完毕后，即可进行消毒。消毒剂应该是一种安全且经批准可用于猪用B超机装置易碎塑料和橡胶部件的消毒剂。消毒剂的选择应遵循制造商的建议，但也可能需要满足特定养猪场的生物安全标准。无论选择哪种方式，消毒剂都可以通过喷雾喷洒，也可以使用干净的一次性纸巾擦拭。然后可以将清洁和消毒的单元放入未使用的一次性塑料袋中并密封。密封的袋子可以放在手提箱内，直到到达下一个养猪场。携带箱如要进入单位，也应进行清洁和消毒。但是，手提箱的某些保护部件无法正确消毒，不应进入不同的单元。